ช่วงเวลาแห่งความสงบสุขกำลังปกครองอยู่ในไวไวเวิลด์ แล้วจู่ ๆ พ่อมดผู้ยิ่งใหญ่ชื่อวารูมงก็โผล่ออกมาจากความมืดและยึดครองดินแดนนี้อย่างรวดเร็ว ในการตอบสนอง ดร.ซีนอามัน ที่หลบหนีการโจมตีเพราะไม่ได้ไปเที่ยวสถานที่ท่องเที่ยว ได้สร้างซูเปอร์โรบอตชื่อ "ริกเคิล" โดยใช้ "วงจรแปลงร่างตัวละครเอกโคนามิ" ที่พัฒนาขึ้นอย่างลับ ๆ และส่งเขาออกไปเพื่อกำจัดวารูมง

เมื่อวารูมงรู้แผนของซีนอามัน เขาก็ลักพาตัวเจ้าหญิงเฮิร์บแห่งไวไวเวิลด์ และพาเธอไปที่ฐานของเขาในอวกาศที่เรียกว่า "ปราสาทพาร์สลีย์" ที่นั่น เขาชุบชีวิตเหล่าวายร้ายที่เคยพ่ายแพ้ให้กับอดีตฮโร่ของโคนามิ และส่งพวกมันไปหยุดยั้งริกเคิล

ตัวละคร

• ริกเคิล (リックル, ริกกูรุ): ตัวเอกของเกม ซึ่งเป็นหุ่นยนต์ที่สร้างโดย ดร.ซีนอามัน
• โกเอมง: นินจาจากซีรีส์กัมบาเระ โกเอมง ผู้กลับมาจากไวไวเวิลด์ เขาขว้างกล้องสูบยาซึ่งใช้เป็นอาวุธดั่งบูมเมอแรง
• ไซมอน เบลมอนต์ ที่สาม: นักฆ่าแวมไพร์จากซีรีส์คาสเซิลวาเนียซึ่งกลับมาจากเกมไวไวเวิลด์ภาคแรก พร้อมแส้เป็นอาวุธ
• เก็ตสึ ฟูมะ: เขามาจากเก็ตสึ ฟูมะ เด็ง ซึ่งเป็นเกมแฟมิคอมที่วางจำหน่ายเฉพาะในญี่ปุ่นผู้ถือดาบเป็นอาวุธ และเขากลับมาจากไวไวเวิลด์เช่นกัน
• อูปา: พระเอกตัวน้อยที่ใช้ของเล่นเด็กที่เขย่ามีเสียงรัวเป็นอาวุธจากเกมไบโอมิราเคิลโบกุตเตะอูปา และเขายังกลับมาจากไวไวเวิลด์เวอร์ชันโทรศัพท์เคลื่อนที่
• บิล ไรเซอร์: ตัวละครเอกสไตล์แรมโบ้จากซีรีส์คอนทรา เขาใช้ปืนกระจายที่สามารถยิงได้หลายทิศทาง
• วิกไวเปอร์: ยานอวกาศจากซีรีส์กราดิอุส ที่ผู้เล่นสามารถใช้ได้สำหรับด่านยิงของกราดิอุสเท่านั้น
• ทวินบี: จากซีรีส์ทวินบี ที่ผู้เล่นสามารถใช้ได้สำหรับด่านยิงของทวินบีเท่านั้น
• ดร.ซีนอามัน: นักวิทยาศาสตร์จากซีรีส์ทวินบี ซึ่งช่วยตัวละครของผู้เล่นตลอดทั้งเกม
• เพนตาโร: เพนกวินจากเกมดรีมเพนกวินสตอรี และซีรีส์พาโรดิอุส